חיטוי מערכות מים הוא תהליך הכרחי שנועד להבטיח שהמים יהיו נקיים, בטוחים לשתייה ולא מכילים חומרים מזיקים. מערכות מים, בין אם מדובר במערכות מים ציבוריות, פרטיות או תעשייתיות, חשופות לזיהומים שעלולים להיגרם ממקורות שונים כמו ביופלימות, חיידקים, וירוסים ואפילו מזהמים כימיים. חיטוי נכון ומדוד מסייע להקטין את הסיכון למחלות הנגרמות משימוש במקורות מים שלא עברו חיטוי מתאים.
באופן כללי, ישנן מספר שיטות לחיטוי מערכות מים. השיטה הנפוצה ביותר היא שימוש בכלור, שהוא חומר חיטוי מוכר ואפקטיבי. הוספת כלור למערכת המים עוזרת להילחם בחיידקים ובמזהמים שונים, אך חשוב להקפיד על רמות החיטוי כדי לא לגרום לתופעות לוואי כמו ריח או טעם לא נעים. בנוסף לכלור, קיימות שיטות חיטוי אחרות כמו חיטוי באמצעות UV, בו פועלים קר